隨著三代火影猿飛日斬正式宣布開啟第四代火影的競選，沉寂許久的村子又開始熱鬧起來。
以自來也為代表的一派支持波風水門，波風水門在第三次忍界大戰(zhàn)以黃色閃光之名斬首無數(shù)，力敵云隱的艾比兄弟，還在神無毗橋之戰(zhàn)中摧毀敵軍戰(zhàn)略補給通道，加速了三戰(zhàn)結(jié)束的進程，光環(huán)閃耀。
團藏則為了讓自己掌握更大的權(quán)力，力推木葉三忍之一的大蛇丸。如果說波風水門的戰(zhàn)績更多的是個人戰(zhàn)績，那么大蛇丸則是在戰(zhàn)場把控和團隊作戰(zhàn)上做出了突出貢獻，尤其在對陣敵方忍村大部隊方面，大蛇丸為木葉贏得了戰(zhàn)術(shù)勝利。
然而相比而言，群體勝利的光環(huán)似乎遠遠比不上個人英雄主義的光環(huán)，加上大蛇丸個人性情冷淡，戰(zhàn)場上冷酷無情，這讓他在競選火影的道路上失去了民心，自然而然敗選下來。
競選失敗之后，大蛇丸將重心轉(zhuǎn)移到人體實驗，醉心各種禁術(shù)和長生之術(shù)。
“大蛇丸，木遁的研究進行到哪一步了？”一個右眼藏著繃帶的老人出現(xiàn)在一處地下基地，正是根部的首領(lǐng)-團藏。這些年，團藏和大蛇丸一直在合作開發(fā)柱間細胞，以期可以重新展現(xiàn)初代火影千手柱間的木遁輝煌。
“柱間細胞的融合需要非常強大的身體適應性，大部分實驗體都失敗了?！贝笊咄柚噶酥干砗笈_子上那些死去的實驗體，不禁有些遺憾地感嘆到。
“咦！”突然大蛇丸和團藏同時發(fā)現(xiàn)當中的一具實驗體的臺子上長出了綠芽，兩人眼中對視一眼，成功了，這個實驗體抗住了柱間細胞的反噬，緊接著雙方迅速來到實驗體臺子上，這具實驗體還活著。
“大蛇丸，木遁實驗體必須交給根部處理！”團藏不由分說就要帶走這具實驗體。
“這可不行，我還需要進一步的研究！”三條蛇影從大蛇丸手中激射而出，喝退了團藏。
雙方沉默了幾秒，隨即激斗在一起，兩人都是影級實力，戰(zhàn)斗很快爆發(fā)出強烈的聲響，吸引了全村的注意。
波風水門和猿飛日斬很快趕到了現(xiàn)場，看著滿地實驗體，波風水門非常震怒，要求即刻追緝大蛇丸。猿飛日斬深深看了團藏一眼，這里面絕對有他的一份子盡管對方狡黠辯稱是因為意外發(fā)現(xiàn)此處基地才會與大蛇丸激戰(zhàn)，但是猿飛日斬一個字都不信。
作為唯一成功的木遁實驗體大和，波風水門毫不留情地拒絕了團藏想要接納到根部培養(yǎng)的提議，直接宣布歸屬于火影直屬暗部培養(yǎng)，并且嚴厲警告了團藏收斂根部，這讓團藏對于這位新上任的四代火影有了進一步的認識。
在留下命令銷毀此處基地之后，大部隊就開始追緝逃走的大蛇丸。誰也沒發(fā)現(xiàn)一條白色的小蛇正游走在坍塌的實驗基地里，正當小蛇找到了某樣東西，張開大嘴準備將眼前的資料吐進去時，一道白光閃過，這條小蛇瞬間消亡。
正處于木葉邊境的大蛇丸第一時間感知到自己的通靈白蛇消失了，不禁撇了撇舌頭：有意思，竟然還有人想要我的實驗數(shù)據(jù)，到底是誰呢？
沒錯，盜走木遁實驗數(shù)據(jù)和柱間細胞的正是山崎，千手翔太作為千手一族的后裔，在開發(fā)木遁上有得天獨厚的優(yōu)勢，而山崎也非常需要一個強大的千手翔太來幫助他們的事業(yè)。
三代火影最終因為顧念師徒之情，在木葉邊境放走了大蛇丸，不知道當他知道大蛇丸在未來將卷土重來，進行木葉毀滅計劃之后會是怎樣的心情。
最終四代火影波風水門將大蛇丸定義為木葉S級叛忍，這件事就此告一段落。而幾天之后，木葉高層才收到山崎和千手翔太失蹤的消息，但是因為沒有任何打斗的痕跡，也沒有木葉邊境他們離開的報告，所以這樁失蹤案撲朔迷離，最終不了了之。
時間回溯到大蛇丸與三代火影對峙時刻，木葉另一側(cè)截然相反的邊境，帶著木葉護額的邊境小隊正在巡邏，突然一群黑色的烏鴉飛過，隨即幾只烏鴉落到了他們肩上，仔細一看會發(fā)現(xiàn)烏鴉的雙眼有一個風車圖案，隨即剛剛還精神奕奕的巡邏小隊突然雙眼失神，呆立在原地。
三道身影從林中竄出，正是宇智波繪梨、千手翔太和山崎。千手翔太跑到雙目呆滯的邊境隊員面前揮了揮手，隨即向宇智波繪梨豎起了大拇指。剛剛的幻術(shù)正是宇智波繪梨覺醒了萬花筒寫輪眼以后右眼的能力-真實之境，中術(shù)者不會有任何身體的不適，清醒之后也不會記得剛剛經(jīng)歷的一切；而她左眼的能力則是最強火遁-天照，這倒是和山崎熟知的宇智波鼬覺醒的能力相同，也許是因為宇智波一族向來在火遁上天賦卓絕。
“萬花筒能不用就盡量少用”山崎認真地對宇智波繪梨說到，這種開掛的瞳術(shù)會逐漸泯滅持有者的視力，最終變成瞎子，只有再次移植同樣有萬花筒寫輪眼的血親才能破解詛咒，晉升為永恒萬花筒。
雖然不清楚山崎為什么知曉這么隱秘的情報，但是宇智波繪梨還是點點頭。
“你兩能別溫存了嗎！再不走就來不及了！”千手翔太不合時宜地破壞了氣氛，兩人轉(zhuǎn)頭瞪了他一眼，嚇得他趕緊閉嘴。
緊接著就見山崎雙手貼在木葉邊境的結(jié)界上，一個兩人通過的小門出現(xiàn)，山崎和千手翔太就消失在宇智波繪梨的眼中。作為精通封印術(shù)的山崎，木葉邊境的結(jié)界對于他來說形同虛設。
而之所以大費周章以失蹤的名義離開，就在于山崎需要足夠的時間來蟄伏和壯大自己的實力和勢力，如果以叛逃的名義無疑會吸引到非常多關(guān)注的眼光，對于他的行動非常不便。
宇智波繪梨離開以后，邊境巡邏小隊的眼神重新煥發(fā)了神采，疑惑地看看天空，好像做了一個夢，但是具體是什么他們?nèi)粵]有印象。