第二十九章 信息生命體(九)
7.討論
我們當(dāng)前對(duì)所有尺度生命更深的理解,都正趨向于將決定生命屬性的概念定義在信息上(Nurse 2008),即使它可能并非真的最重要。正如本文已經(jīng)部分回顧那樣,信息理論的工具已經(jīng)被用來(lái)解釋各種生物現(xiàn)象,從大腦神經(jīng)元的放電(Honey et al. 2007;Vakorin et al. 2009;Ito et al. 2011;Lizier et al. 2011),到魚群的行為(Butail et al. 2014,2016;Mwaffo et al 2017;Crosato et al. 2018),再到細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)信號(hào)傳遞(Chong et al. 2011;Rhee et al. 2012;Selimkhanov et al. 2014)。與此同時(shí),要實(shí)現(xiàn)真正的“生命系統(tǒng)物理學(xué)”,需要對(duì)生命有比目前已知的更基本的理解(Bialek 2012)。其中懸而未決最具挑戰(zhàn)性的問(wèn)題之一是缺乏區(qū)分生命系統(tǒng)和非生命系統(tǒng)的可量化指標(biāo)(Clel& Chyba 2002; Davies & Walker 2016)。雖然現(xiàn)代生物學(xué)的大部分研究?jī)?nèi)容,可以在沒(méi)有對(duì)生命是什么(以及不是什么)有深入的數(shù)學(xué)理解的情況下進(jìn)行,但在某些科學(xué)領(lǐng)域,客觀的、可測(cè)量的生命構(gòu)成標(biāo)準(zhǔn)是絕對(duì)關(guān)鍵的:這些標(biāo)準(zhǔn)包括生命的起源和對(duì)外星生命的探索(Walker 2017)。在我們努力在實(shí)驗(yàn)室(Cronin & Walker,2016)或其他星球(Walker et al. 2018)尋找新生命實(shí)例的過(guò)程中,可量化的指標(biāo)將成為決定性因素——允許在實(shí)驗(yàn)室中設(shè)計(jì)可進(jìn)化的化學(xué)系統(tǒng),穿越從非生命到生命的小徑,或允許對(duì)生命進(jìn)行明確探測(cè),即使它可能存在于與已知生命完全不同的化學(xué)成分中。
在建立對(duì)生命的定量理解方面,最大的障礙之一是我們?nèi)狈m當(dāng)?shù)目刂苼?lái)隔離生命過(guò)程的物理機(jī)制。雖然標(biāo)準(zhǔn)物理學(xué)對(duì)生命的運(yùn)作有了一定合理的理解(Schrdinger 1992; Hoffmann 2012),但我們迄今為止還沒(méi)有設(shè)計(jì)出有效的實(shí)驗(yàn)隔離,證明生物系統(tǒng)和非生物系統(tǒng)屬性是否能夠進(jìn)行直接比較,或是否能解決非生命和生命系統(tǒng)之間集群行為的差異。亦或許沒(méi)有這樣的區(qū)分更有意義。為解決研究生命過(guò)程中物理機(jī)制需要更好的控制的問(wèn)題,我們提出了一套想法,建立了一個(gè)框架,在這個(gè)框架中讓生命存在于一個(gè)連續(xù)譜上,從我們目前認(rèn)為可能表現(xiàn)出一些“類生命”行為的非生命系統(tǒng),一直到行星規(guī)模的文明。這是生命可能存在于一個(gè)光譜中想法的自然結(jié)果,在這個(gè)光譜中,其中一些系統(tǒng)比另一些更有生命力,關(guān)鍵的區(qū)別屬性是它們的信息架構(gòu)。雖然我們認(rèn)為這樣尺度的生命可能存在,但還沒(méi)能為這種尺度建立適當(dāng)?shù)亩攘繕?biāo)準(zhǔn),也沒(méi)有在上面放置特定的例子。
其中面臨的挑戰(zhàn)之一是,對(duì)許多群體系統(tǒng)之間的比較分析仍有待嚴(yán)格制定和界定。我們認(rèn)為信息論方法是最有前途的,因?yàn)樗鼈儾蹲降搅宋锢硐到y(tǒng)在時(shí)空中存在相關(guān)的因果結(jié)構(gòu),提供了一個(gè)足夠抽象和嚴(yán)格的數(shù)學(xué)框架,是我們發(fā)現(xiàn)生命過(guò)程的各種物理介質(zhì)和尺度中量化生命的候選方法。而為了做出群體決策,個(gè)體必須共享信息,因此對(duì)群體系統(tǒng)中信息流的嚴(yán)格量化是可能提供新見解的一種途徑,使人們了解新的計(jì)算類型(例如決策)如何從單個(gè)代理的行動(dòng)中產(chǎn)生。
隨著人工智能和信息理論應(yīng)用的發(fā)展,現(xiàn)在可以通過(guò)許多不同的渠道提取生物行為的算法來(lái)處理生命系統(tǒng)中的信息,例如運(yùn)動(dòng)、形態(tài)學(xué)和生物電場(chǎng)。然而,盡管在概念和技術(shù)應(yīng)用方面都取得了進(jìn)展,但尚未進(jìn)行系統(tǒng)的分析,直接將生命系統(tǒng)的信息特性與非生命系統(tǒng)進(jìn)行比較,對(duì)生命系統(tǒng)的信息特性進(jìn)行量化。大多數(shù)生物模型都是用硅片樹脂或機(jī)器人建造的,這意味著不可能直接將這些模擬系統(tǒng)的物理性質(zhì)與生物系統(tǒng)進(jìn)行比較,畢竟后者存在于潮濕、混亂的化學(xué)環(huán)境中。
這在很大程度上限制了當(dāng)前人工生命模型區(qū)分表現(xiàn)為“類生命”和嚴(yán)格作為生命物質(zhì)的能力。
“一個(gè)例子:行為相似但機(jī)制不同的跨集體的信息架構(gòu)”一節(jié)中的例子表明,如果它不能捕獲局部級(jí)別的規(guī)則,那么不同系統(tǒng)中相同模擬的行為可能是不夠的,因?yàn)樾畔⒘鲗⒂兴煌?。因此,如果只是天真地?gòu)建硅片模擬系統(tǒng),可能不足以理解真實(shí)生物過(guò)程中的物理信息流。我們已經(jīng)證明信息理論對(duì)特定規(guī)則選擇是敏感的,而在計(jì)算機(jī)中建模者會(huì)顯式地選擇規(guī)則,這就使得計(jì)算機(jī)模擬生命中的信息結(jié)構(gòu)與真實(shí)世界生物系統(tǒng)相比會(huì)直接存在差異。特別是,真實(shí)生命不允許孤立系統(tǒng)中的信息流結(jié)構(gòu)(譯注:如封閉的計(jì)算機(jī)中),不會(huì)超越或超出物理和化學(xué)法則進(jìn)行外顯編碼(譯注:如人工智能軟件系統(tǒng)的特殊規(guī)則),我們假設(shè)這是理解生命物理學(xué)的關(guān)鍵一步(Walker&Davies 2013)。
此外,計(jì)算機(jī)模型通常是真實(shí)世界過(guò)程的低維表示,因此不能捕捉到生物體們處理信息的所有多重信道。向前推進(jìn)的一條可能道路是建立活體系統(tǒng)的物理模擬。例如,油滴混合物中演化的集體行為提供了一種非生命系統(tǒng)物理中模擬生物特性的方法,而不僅僅是在計(jì)算機(jī)中模擬(Taylor et al. 2017;Points et al. 2018)。因此,解決我們?cè)谶@里提出的問(wèn)題的一條途徑是開發(fā)活體系統(tǒng)的物理模擬,作為探索信息流物理的一種手段。
當(dāng)然,要確定這種方法是否會(huì)最終能取得成果,還有很多工作要做;但我們認(rèn)為,為理解集群行為,何時(shí)可歸因于生命過(guò)程、何時(shí)又不能,朝這個(gè)方向邁出步伐的努力,尤其是研究并提供新的定量理論和工具,將源源不斷提供新的見解并促使生物學(xué)持續(xù)發(fā)展。