在《大唐雙龍傳》中有所謂佛與魔的千年爭斗，這不只是正邪之分，也是思想與智慧的道統(tǒng)之爭。魔門本來叫圣門，西漢的董仲舒罷黜百家獨尊儒術之后，正統(tǒng)的教派都對他們展開了打壓與剿滅，但是他們依然生存了下來，所以成為世人眼中的魔，也被稱為魔門。因為魔門不講仁義道德，一切都以利益為先，所以魔門中人常常為達目的不擇手段，這不是一般人能夠接受的，所以也就與佛道兩門展開了上千年的斗爭，這些爭斗皆在暗中進行甚少有人知道。
正道雖打壓魔門多年，卻依然拿對方沒有辦法，雙方也產生了一些斗爭的默契。但這種默契卻在一個人的手中結束了——他叫石之軒人稱邪王，他是魔門百年不出的奇才，他身兼魔門“花間派”和“補天道”的掌門，他化名裴矩出仕為官，他讓好大喜功的楊廣不斷出兵，導致統(tǒng)一數十年的中國又要重歸亂世。
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魔門的人也趁機擴張勢力，因為他們受佛道打壓已久，這時好不容易占了上風，所以不斷派出門人支持門閥中人，或是占據城池割據，而佛道中人一向習慣把守自身不擾世事，所以不太方便出山來管塵世間的亂世。但是他們沒有想到，意外修煉成“長生訣”的寇仲與徐子陵，總是亂拳打死老師傅，他們每每在意外之中破壞了魔門的好事，這兩個看似不起眼的小子更是逐漸成長成一方高手，成為破壞與亂源的集合體。
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佛門以慈航靜齋為首，里面都是女尼，修煉的“慈航劍典”與“長生訣”同為武林四大奇書，剩下的兩大奇書則是魔門陰癸派的絕學“天魔策”和最神秘莫測的“戰(zhàn)神圖錄”。佛門最強四人被稱為四大圣僧，他們的修為已達出神入化之境，與道門的中土第一高手散人寧道奇，共同為中原武林的泰斗，但他們終究都是修行中人，不太愿意干擾世事太多，于是支持李唐政權的李世民。
佛道兩門打算來讓李唐來統(tǒng)一天下，可是以陰癸派為首的魔門中人可不想束手就擒，他們混入李唐政權，成為李閥之主的李淵的心腹，他們打算顛覆李唐政權，并且想要將正道支持的李世民殺掉。
因為李閥的正式繼承人是太子李建成，而李閥之主李淵則長期在皇宮里受到妃嬪與李建成等皇族的耳語，李淵也認為李世民有一天可能會擁兵自立，所以有想要將李世民軍權收回，甚至有置于死地的想法，至于齊王李元吉則想制造混亂來讓李建成、李世民都死了，他成為唐主。在這樣的情況下，如果唐室有外敵的一天，李世民便不會被召回殺害，所以寇仲與徐子陵加入了王世充的一方。